Pierwszą rzeczą jaką powinniśmy zrobić przy założeniu spółki z ograniczoną odpowiedzialnością jest wpis do Rejestru Handlowego Estonii. Wpis wiąże się z dodatkowymi kosztami - 0,2% kapitału założycielskiego spółki z ograniczoną odpowiedzialnością, czyli minimum 3 tysiące, maksimum 20 tysięcy EEK. Kapitał założycielski spółki z ograniczoną odpowiedzialnością wynosi minimum 40 tys. EEK. Następnie należy założyć konto bankowe, co wiąże się z ponoszeniem dodatkowych opłat - 300 EEK miesięcznie. Przed rejestracją należy przygotować i podpisać akt założycielski spółki z ograniczoną odpowiedzialnością. Następnie należy potwierdzić go notarialnie. W ciągu sześciu miesięcy od podpisania aktu założycielskiego zarząd spółki z ograniczoną odpowiedzialnością musi zarejestrować ją w Rejestrze Handlowym. Rejestracja trwa zazwyczaj około 3 tygodni i kosztuje właścicieli spółki 0,2 % wartości kapitału założycielskiego. Wszystkie dostarczane dokumenty muszą być sporządzone w języku estońskim, a w przypadku zakładania spółki przez osobę z zagranicy przetłumaczone na język estoński przez przysięgłego tłumacza.